深中通道主體工程全長23.879千米,跨海長度22.405千米,陸地段長度1.64千米,橋梁段長17.2千米,非通航孔橋11.4千米;路基寬度41米,橋梁寬度40.5米(唔含布索區),隧道淨寬36米(2x18.5米);橋涵設計汽車荷載等級採用公路-Ⅰ級。
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深中通道主路段為雙向八車道高速公路,設計速度100千米/小時。橋面橫坡2.5%,為雙幅路,其中單幅路為"0.5米(護欄)+3.0米(緊急停車帶)+4x3.75米(行車道)+0.75米(路緣帶)+1.0米(中央分隔帶)” ,單向四車道寬度18米。
深中通道萬頃沙支線採用雙向六車道高速公路標準建設,設計速度100千米/小時。萬頃沙互通海上立交橋南沙往返深圳方向按13.75米雙車道、南沙往返中山方向按單車道出入口嘅雙車道匝道設置。
深中通道深圳連接線全長5.7千米,為雙向八車道高速公路,設計速度100千米/小時。
深中通道主體設計使用年限100年,設計洪水頻率300年一遇;地震設防標準採用地震基本烈度Ⅶ度;可唔頂17級颱風。